Komitmen kami selalu memberikan pelayanan terbaik bagi semua pelanggan dengan tetap mengutamakan mutu dan keselamatan pasien. Sampai dengan saat ini, beberapa pengharagaan yang telah didapat oleh Rumah Sakit Islam Fatimah Cilacap baik skala Internasional, Nasional maupun Daerah, antara lain :

1. Partisipasi pada program PONEK tahun 2016 dari Dinkes Provinsi Jateng dan USAID (United Statesagency International Development)
2. Partisipasi dalam Program P2HA (Pencegahan dan Penanggulangan HIV-AIDS) di tempat Kerja dalam rangka Hari AIDS sedunia tahun 2017 dari Bupati Cilacap
3. Partisipasi dalam program CSR JKN-KIS Premi BPJS untuk masyarakat sekitar (Pondok Pesantren Mahad Imam Ali Syafi’i) tahun 2017 dari BPJS Kesehatan
4. Peduli JKN-KIS untuk Indonesia (dukungan dan gotong royong terhadap program JKN-KIS) tahun 2018 dari BPJS Kesehatan
5. Pemenuhan kewajiban perpajakan tahun 2018 dari Kantor Pelayanan Pajak Pratama Cilacap
6. Top 10 Rumah Sakit terbaik dalam komitmen dalam pelayanan peserta se- Jawa Tengah dan DIY tahun 2018 versi Mandiri Inhealth
7. Penghargaan Program P2-HIV (Pencegahan dan Penanggulangan HIV-AIDS) di tempat Kerja dengan kategori PLATINUM tahun 2018 dari Bupati Cilacap dari Kementrian Tenaga Kerja RI
8. Peduli JKN-KIS (dukungan gotong royong terhadap program JKN-KIS) tahun 2019 dari BPJS Kesehatan 
9. Sebagai Rumah Sakit dengan Utilisasi RS tertinggi tahun 2019 Se Cilacap-Kebumen dari BPJS Ketenagakerjaan
10. Pengelolaan Lingkungan Hidup (Proper Biru) tahun 2019 dari Bupati Cilacap
11. UPZ tergiat 1 antar Rumah Sakit di Kabupaten Cilacap tahun 2019 dari Baznas Cilacap.
12. Program Penghargaan sebagai Perusahaan yang aktif melaporkan Kegiatan Panitia Pembina Keselamatan dan Kesehatan Kerja tahun 2019 dari Pemerintah Provinsi Jawa Tengah Dinas tenaga Kerja dan Transmigrasi
13. Kontribusi mendaftarkan peserta PBPU Kolektif pada Program JKN-KIS tahun 2020 dari BPJS Kesehatan
14. Sebagai Rumah Sakit Terbersih Faskes Rujukan Tingkat Lanjutan tahun 2020 dari BPJS Kesehatan
15. Program Pencegahan dan Penanggulangan Covid 19 di tempat kerja kategori Platinum tahun 2021 dari Menteri Ketenagakerjaan.
16. Penghargaan TJSLP (Tanggung Jawab Sosial Lingkungan Perusahaan/CSR) Kategori Terbaik 1 Jasa Kesehatan tahun 2022 dari Bupati Cilacap
17. Penghargaan penilaian LKS Bipartit (terbaik ke 10 tingkat Provinsi Jawa Tengah) tahun 2022 dari Dinas Tenaga Kerja Provinsi Jawa Tengah
18. Partisipasi memberikan perlindungan kepada tenaga kerja rentan di Kabupaten Cilacap Tahun 2022 dari BPJS Ketenagakerjaan
19. Paritrana Award-Juara 3, Kategori badan usaha layanan publik tahun 2022 dari Pemerintah Provinsi Jawa Tengah 
20. Penghargaan Sertifikat Keikutsertaan 100% BPJS Kesehatan untuk karyawan RSI Fatimah Cilacap dan anggota keluarganya dalam program JKN-KIS tahun 2023 dari BPJS Kesehatan
21. Penghargaan TJSLP (Tanggung Jawab Sosial Lingkungan Perusahaan/CSR) Award Kategori Terbaik 1 Jasa Kesehatan tahun 2023 dari Bupati Cilacap