Hemodelisa adalah metode pencucian darah dengan membung cairan berlebih dan zat-zat yang berbahaya bagi tubuh melalui alat dialisis untuk menggantikan fungsi ginjal yang rusak. Instalasi Hemodialisa Rumah Sakit Islam Fatimah Cilacap dibuka sejak tahun 2004, sekarang instalasi ini dilengkapi dengan 25 Mesin Hemodialisa, alat-alat yang sesuai standar dan ditangani oleh perawat ahli di bidangnya. Dengan penataan ruang yang teratur dan dilengkapi dengan televisi serta ruang ber AC membuat suasana menjadi nyaman baik untuk pasien maupun penunggu pasien. instalasi Hemodelisa memberikan pelayanan setiap hari pagi dan sore kecuali hari ahad libur